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"# Hyper Parameter Optimization"
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@ -1289,7 +1289,7 @@
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@ -1311,7 +1311,7 @@
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@ -2,7 +2,7 @@
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"### Load MNIST dataset"
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@ -11,7 +11,7 @@
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@ -23,7 +23,7 @@
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|
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@ -35,7 +35,7 @@
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@ -46,7 +46,7 @@
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@ -73,7 +73,7 @@
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"cell_type": "markdown",
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|
"source": [
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||||||
"Bunch objects are sometimes used as an output for functions and methods. They extend dictionaries by enabling values to be accessed by key, bunch[\"value_key\"], or by an attribute, bunch.value_key.\\\n",
|
"Bunch objects are sometimes used as an output for functions and methods. They extend dictionaries by enabling values to be accessed by key, bunch[\"value_key\"], or by an attribute, bunch.value_key.\\\n",
|
||||||
|
@ -83,7 +83,7 @@
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@ -106,7 +106,7 @@
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"execution_count": 6,
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@ -127,7 +127,7 @@
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|
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|
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|
"source": [
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||||||
"Datasets loaded by Scikit-Learn generally have a similar dictionary structure, including the following:\\\n",
|
"Datasets loaded by Scikit-Learn generally have a similar dictionary structure, including the following:\\\n",
|
||||||
|
@ -139,7 +139,7 @@
|
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{
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|
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@ -159,7 +159,7 @@
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|
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|
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"### Prepare the MNIST dataset"
|
"### Prepare the MNIST dataset"
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@ -167,7 +167,7 @@
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|
"$f(X) = y$\n",
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@ -181,7 +181,7 @@
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|
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@ -191,7 +191,7 @@
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|
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@ -212,7 +212,7 @@
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@ -233,7 +233,7 @@
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@ -253,7 +253,7 @@
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@ -262,7 +262,7 @@
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|
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|
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@ -413,7 +413,7 @@
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{
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|
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|
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|
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|
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"### Prepare data for machine learning"
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{
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|
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"execution_count": 22,
|
"execution_count": 22,
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|
"metadata": {},
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"outputs": [
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{
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@ -485,7 +485,7 @@
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{
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|
"cell_type": "code",
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"execution_count": 23,
|
"execution_count": 23,
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|
"metadata": {},
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"outputs": [],
|
"outputs": [],
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"source": [
|
"source": [
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@ -495,7 +495,7 @@
|
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|
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{
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{
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"cell_type": "markdown",
|
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"source": [
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"### Train classifier"
|
"### Train classifier"
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@ -504,7 +504,7 @@
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"cell_type": "code",
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"cell_type": "code",
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"execution_count": 24,
|
"execution_count": 24,
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"### Evaluation"
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@ -677,7 +677,7 @@
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@ -697,7 +697,7 @@
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"Accuracy is strongly influenced by the distribution of the classes in the test data."
|
"Accuracy is strongly influenced by the distribution of the classes in the test data."
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@ -705,7 +705,7 @@
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"#### Cross Validation\n",
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@ -715,7 +715,7 @@
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@ -736,7 +736,7 @@
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@ -759,7 +759,7 @@
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"#### Precision"
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"#### Precision"
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@ -790,7 +790,7 @@
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"#### Recall"
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@ -799,7 +799,7 @@
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@ -821,7 +821,7 @@
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"#### F1 Score"
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@ -830,7 +830,7 @@
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@ -852,7 +852,7 @@
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"#### Confusion Matrix"
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@ -861,7 +861,7 @@
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@ -891,7 +891,7 @@
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@ -929,7 +929,7 @@
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@ -940,7 +940,7 @@
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@ -970,7 +970,7 @@
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@ -1006,7 +1006,7 @@
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@ -1028,7 +1028,7 @@
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@ -3,7 +3,7 @@
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@ -16,7 +16,7 @@
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@ -32,7 +32,7 @@
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@ -48,7 +48,7 @@
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@ -67,7 +67,7 @@
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@ -89,7 +89,7 @@
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@ -121,7 +121,7 @@
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@ -147,7 +147,7 @@
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@ -160,7 +160,7 @@
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@ -675,7 +675,7 @@
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"cell_type": "code",
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|
"execution_count": 11,
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"source": [
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|
@ -714,7 +714,7 @@
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{
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|
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|
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|
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|
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|
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|
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|
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|
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|
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|
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|
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|
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|
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|
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|
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|
|
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@ -3,7 +3,7 @@
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|
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|
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|
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@ -19,7 +19,7 @@
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|
"execution_count": 2,
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|
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|
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|
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|
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|
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|
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|
"execution_count": 4,
|
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|
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|
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|
||||||
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@ -146,7 +146,7 @@
|
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{
|
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|
"cell_type": "code",
|
||||||
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|
"execution_count": 5,
|
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|
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|
"metadata": {},
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"outputs": [
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@ -192,7 +192,7 @@
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{
|
{
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"cell_type": "code",
|
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|
"execution_count": null,
|
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|
"metadata": {},
|
||||||
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|
"outputs": [],
|
||||||
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|
"source": []
|
||||||
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@ -214,7 +214,7 @@
|
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|
"name": "python",
|
||||||
"nbconvert_exporter": "python",
|
"nbconvert_exporter": "python",
|
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|
"pygments_lexer": "ipython3",
|
||||||
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|
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|
||||||
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|
}
|
||||||
},
|
},
|
||||||
"nbformat": 4,
|
"nbformat": 4,
|
||||||
|
|
|
@ -0,0 +1,276 @@
|
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{
|
||||||
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|
||||||
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{
|
||||||
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"cell_type": "code",
|
||||||
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|
||||||
|
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|
||||||
|
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|
||||||
|
"outputs": [
|
||||||
|
{
|
||||||
|
"name": "stderr",
|
||||||
|
"output_type": "stream",
|
||||||
|
"text": [
|
||||||
|
"100%|██████████| 768/768 [01:11<00:00, 10.72it/s]\n"
|
||||||
|
]
|
||||||
|
}
|
||||||
|
],
|
||||||
|
"source": [
|
||||||
|
"import os\n",
|
||||||
|
"from glob import glob\n",
|
||||||
|
"import pandas as pd\n",
|
||||||
|
"from sklearn.model_selection import train_test_split\n",
|
||||||
|
"from sklearn.pipeline import Pipeline\n",
|
||||||
|
"from sklearn.decomposition import PCA, KernelPCA\n",
|
||||||
|
"from sklearn.preprocessing import (StandardScaler, \n",
|
||||||
|
" MinMaxScaler, \n",
|
||||||
|
" MaxAbsScaler,\n",
|
||||||
|
" PowerTransformer,\n",
|
||||||
|
" Binarizer)\n",
|
||||||
|
"\n",
|
||||||
|
"from sklearn.neighbors import KNeighborsClassifier\n",
|
||||||
|
"from sklearn.model_selection import cross_validate\n",
|
||||||
|
"from sklearn.metrics import classification_report, accuracy_score\n",
|
||||||
|
"import numpy as np\n",
|
||||||
|
"import matplotlib.pyplot as plt\n",
|
||||||
|
"from math import isqrt\n",
|
||||||
|
"import pickle\n",
|
||||||
|
"from tqdm import tqdm\n",
|
||||||
|
"import os\n",
|
||||||
|
"\n",
|
||||||
|
"os.environ['TF_FORCE_GPU_ALLOW_GROWTH'] = 'true'\n",
|
||||||
|
"os.environ['CUDA_VISIBLE_DEVICES'] = '2'\n",
|
||||||
|
"\n",
|
||||||
|
"def load_data(user_filter=None):\n",
|
||||||
|
" dic_data = []\n",
|
||||||
|
" \n",
|
||||||
|
" for p in tqdm(glob('/opt/iui-datarelease3-sose2021/*.csv')):\n",
|
||||||
|
" path = p\n",
|
||||||
|
" filename = path.split('/')[-1]\n",
|
||||||
|
" user = int(filename.split('_')[0][1:])\n",
|
||||||
|
" if (user_filter):\n",
|
||||||
|
" if (user != user_filter):\n",
|
||||||
|
" continue\n",
|
||||||
|
" scenario = filename.split('_')[1][len('Scenario'):]\n",
|
||||||
|
" heightnorm = filename.split('_')[2][len('HeightNormalization'):] == 'True'\n",
|
||||||
|
" armnorm = filename.split('_')[3][len('ArmNormalization'):] == 'True'\n",
|
||||||
|
" rep = int(filename.split('.')[0].split('_')[4][len('Repetition'):])\n",
|
||||||
|
" session = filename.split('_')[5][len('Session'):]\n",
|
||||||
|
" session = session.split('.')[0]\n",
|
||||||
|
" \n",
|
||||||
|
" data = pd.read_csv(path)\n",
|
||||||
|
" dic_data.append(\n",
|
||||||
|
" {\n",
|
||||||
|
" 'filename': path,\n",
|
||||||
|
" 'user': user,\n",
|
||||||
|
" 'scenario': scenario,\n",
|
||||||
|
" 'heightnorm': heightnorm,\n",
|
||||||
|
" 'armnorm': armnorm,\n",
|
||||||
|
" 'rep': rep,\n",
|
||||||
|
" 'session': session,\n",
|
||||||
|
" 'data': data \n",
|
||||||
|
" \n",
|
||||||
|
" }\n",
|
||||||
|
" )\n",
|
||||||
|
" return dic_data\n",
|
||||||
|
"\n",
|
||||||
|
"dic_data = load_data()"
|
||||||
|
]
|
||||||
|
},
|
||||||
|
{
|
||||||
|
"cell_type": "code",
|
||||||
|
"execution_count": 2,
|
||||||
|
"id": "3df066af",
|
||||||
|
"metadata": {},
|
||||||
|
"outputs": [],
|
||||||
|
"source": [
|
||||||
|
"\n",
|
||||||
|
"# dataP = pd.DataFrame.from_dict(fil_dic_data) #pandas Dataframe Form mit 'data0' nur die daten\n",
|
||||||
|
"\n",
|
||||||
|
"# tempP = dataP['data']\n",
|
||||||
|
"\n",
|
||||||
|
"# tempP = tempP[0].drop(columns=['Scenario','HeightNormalization','ArmNormalization','LeftHandTrackingAccuracy','RightHandTrackingAccuracy']) #P without String Data\n"
|
||||||
|
]
|
||||||
|
},
|
||||||
|
{
|
||||||
|
"cell_type": "code",
|
||||||
|
"execution_count": 3,
|
||||||
|
"id": "30296cad",
|
||||||
|
"metadata": {},
|
||||||
|
"outputs": [],
|
||||||
|
"source": [
|
||||||
|
"fil_dic_data = []\n",
|
||||||
|
"for d in dic_data:\n",
|
||||||
|
" if d['scenario'] == 'Sorting':\n",
|
||||||
|
" if d['heightnorm'] == d['armnorm']:\n",
|
||||||
|
" fil_dic_data.append(d)"
|
||||||
|
]
|
||||||
|
},
|
||||||
|
{
|
||||||
|
"cell_type": "markdown",
|
||||||
|
"id": "7a808f50",
|
||||||
|
"metadata": {},
|
||||||
|
"source": [
|
||||||
|
"Test\n"
|
||||||
|
]
|
||||||
|
},
|
||||||
|
{
|
||||||
|
"cell_type": "code",
|
||||||
|
"execution_count": 4,
|
||||||
|
"id": "dc206ded",
|
||||||
|
"metadata": {},
|
||||||
|
"outputs": [],
|
||||||
|
"source": [
|
||||||
|
"min_Max = MinMaxScaler()\n",
|
||||||
|
"standard = StandardScaler()\n",
|
||||||
|
"max_Abs = MaxAbsScaler()\n",
|
||||||
|
"binarizer = Binarizer()\n"
|
||||||
|
]
|
||||||
|
},
|
||||||
|
{
|
||||||
|
"cell_type": "code",
|
||||||
|
"execution_count": 5,
|
||||||
|
"id": "cf5b5695",
|
||||||
|
"metadata": {},
|
||||||
|
"outputs": [],
|
||||||
|
"source": [
|
||||||
|
"session_data_1 = []\n",
|
||||||
|
"session_data_2 = []\n",
|
||||||
|
"\n",
|
||||||
|
"user_data_1 = []\n",
|
||||||
|
"user_data_2 = []\n",
|
||||||
|
"\n",
|
||||||
|
"data_1 = []\n",
|
||||||
|
"data_2 = []\n",
|
||||||
|
"\n",
|
||||||
|
"for a in fil_dic_data:\n",
|
||||||
|
" if(a['session'] == '1'): ## Daten aus session 1 für train\n",
|
||||||
|
" session_data_1.append(a)\n",
|
||||||
|
" \n",
|
||||||
|
" if(a['session'] == '2'): ## Daten aus Session 2 zum validaten\n",
|
||||||
|
" session_data_2.append(a)\n",
|
||||||
|
"\n",
|
||||||
|
"for b in session_data_1:\n",
|
||||||
|
" user_data_1.append(b['user']) ## Label zu 1 \n",
|
||||||
|
" data_1.append(a['data'])\n",
|
||||||
|
" \n",
|
||||||
|
"for c in session_data_2:\n",
|
||||||
|
" user_data_2.append(b['user']) ## Label zu 2\n",
|
||||||
|
" data_2.append(a['data'])\n",
|
||||||
|
" \n",
|
||||||
|
" \n",
|
||||||
|
" "
|
||||||
|
]
|
||||||
|
},
|
||||||
|
{
|
||||||
|
"cell_type": "code",
|
||||||
|
"execution_count": 6,
|
||||||
|
"id": "82465bca",
|
||||||
|
"metadata": {},
|
||||||
|
"outputs": [
|
||||||
|
{
|
||||||
|
"name": "stderr",
|
||||||
|
"output_type": "stream",
|
||||||
|
"text": [
|
||||||
|
"100%|██████████| 96/96 [00:00<00:00, 575.65it/s]\n",
|
||||||
|
"100%|██████████| 96/96 [00:00<00:00, 646.85it/s]\n"
|
||||||
|
]
|
||||||
|
}
|
||||||
|
],
|
||||||
|
"source": [
|
||||||
|
"dataF_1 = [] ## Filtered Data session 1\n",
|
||||||
|
"dataF_2 = [] ## Filtered Data session 2\n",
|
||||||
|
"\n",
|
||||||
|
"temp_1 = [] ## Temp Holder für 1\n",
|
||||||
|
"temp_2 = [] ## Temp Holder für 2\n",
|
||||||
|
"\n",
|
||||||
|
"counter = 0 ## Counter für Einspeisen der Daten\n",
|
||||||
|
"\n",
|
||||||
|
"\n",
|
||||||
|
"for a in data_1:\n",
|
||||||
|
" temp_1.append(pd.DataFrame(a))\n",
|
||||||
|
"\n",
|
||||||
|
"for b in data_2:\n",
|
||||||
|
" temp_2.append(pd.DataFrame(b))\n",
|
||||||
|
"\n",
|
||||||
|
"\n",
|
||||||
|
"for c in tqdm(temp_1):\n",
|
||||||
|
" dataF_1.append(c.drop(columns=['Scenario','HeightNormalization','ArmNormalization','LeftHandTrackingAccuracy','RightHandTrackingAccuracy','Unnamed: 0', 'FrameID','participantID','Repetition']))\n",
|
||||||
|
" counter +=1\n",
|
||||||
|
" \n",
|
||||||
|
"counter = 0\n",
|
||||||
|
"\n",
|
||||||
|
"for d in tqdm(temp_2):\n",
|
||||||
|
" dataF_2.append(c.drop(columns=['Scenario','HeightNormalization','ArmNormalization','LeftHandTrackingAccuracy','RightHandTrackingAccuracy','Unnamed: 0', 'FrameID','participantID','Repetition']))\n",
|
||||||
|
" counter +=1\n",
|
||||||
|
" \n"
|
||||||
|
]
|
||||||
|
},
|
||||||
|
{
|
||||||
|
"cell_type": "code",
|
||||||
|
"execution_count": 7,
|
||||||
|
"id": "a6f7076e",
|
||||||
|
"metadata": {},
|
||||||
|
"outputs": [
|
||||||
|
{
|
||||||
|
"name": "stderr",
|
||||||
|
"output_type": "stream",
|
||||||
|
"text": [
|
||||||
|
"100%|██████████| 96/96 [00:03<00:00, 25.87it/s]\n"
|
||||||
|
]
|
||||||
|
}
|
||||||
|
],
|
||||||
|
"source": [
|
||||||
|
"minD = [] ## normalisierte Daten durch Minmax\n",
|
||||||
|
"staD = [] ## normalisierte Daten durch Standard\n",
|
||||||
|
"maxD = [] ## normalisierte Daten durch MaxAbs\n",
|
||||||
|
"binD = [] ## normalisierte Daten durch binarizer\n",
|
||||||
|
"\n",
|
||||||
|
"for i in tqdm(dataF_1):\n",
|
||||||
|
" minD.append( min_Max.fit_transform(i))\n",
|
||||||
|
" staD.append(standard.fit_transform(i))\n",
|
||||||
|
" maxD.append(max_Abs.fit_transform(i))\n",
|
||||||
|
" binD.append(binarizer.fit_transform(i))\n"
|
||||||
|
]
|
||||||
|
},
|
||||||
|
{
|
||||||
|
"cell_type": "code",
|
||||||
|
"execution_count": 8,
|
||||||
|
"id": "94676652",
|
||||||
|
"metadata": {},
|
||||||
|
"outputs": [],
|
||||||
|
"source": [
|
||||||
|
"from sklearn.model_selection import train_test_split\n",
|
||||||
|
"x_train,x_test,y_train,y_test = train_test_split(minD,user_data_1,random_state=2)"
|
||||||
|
]
|
||||||
|
},
|
||||||
|
{
|
||||||
|
"cell_type": "markdown",
|
||||||
|
"id": "14a4abe1",
|
||||||
|
"metadata": {},
|
||||||
|
"source": [
|
||||||
|
"Classi"
|
||||||
|
]
|
||||||
|
}
|
||||||
|
],
|
||||||
|
"metadata": {
|
||||||
|
"kernelspec": {
|
||||||
|
"display_name": "Python 3",
|
||||||
|
"language": "python",
|
||||||
|
"name": "python3"
|
||||||
|
},
|
||||||
|
"language_info": {
|
||||||
|
"codemirror_mode": {
|
||||||
|
"name": "ipython",
|
||||||
|
"version": 3
|
||||||
|
},
|
||||||
|
"file_extension": ".py",
|
||||||
|
"mimetype": "text/x-python",
|
||||||
|
"name": "python",
|
||||||
|
"nbconvert_exporter": "python",
|
||||||
|
"pygments_lexer": "ipython3",
|
||||||
|
"version": "3.8.10"
|
||||||
|
}
|
||||||
|
},
|
||||||
|
"nbformat": 4,
|
||||||
|
"nbformat_minor": 5
|
||||||
|
}
|
File diff suppressed because one or more lines are too long
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